L'histoire commence à New York en 1971, où W. Eugene Smith (Johnny Depp) vit en reclus brisé, criblé de dettes et luttant contre l'alcoolisme ainsi que les traumatismes de son passé de photographe durant la Seconde Guerre mondiale. Sa vie commence à basculer lorsqu'il reçoit la visite d'Aileen Mioko Smith (Minami), une jeune traductrice et militante nippo-américaine qui l'invite à se rendre dans la ville côtière de Minamata, dans la préfecture de Kumamoto au Japon. Là-bas, des milliers d'habitants souffrent de paralysie neurologique, de cécité et de graves malformations congénitales causées par les eaux usées chargées de mercure déversées délibérément dans la mer par le géant de la chimie Chisso Corporation.
D'abord réticent, Eugene accepte finalement de partir au Japon après avoir convaincu le rédacteur en chef du magazine Life, Robert Hayes (Bill Nighy), de financer ce reportage d'investigation. À son arrivée à Minamata, Eugene se heurte à la méfiance des habitants ainsi qu'aux intimidations brutales de l'entreprise, qui tente de dissimuler ses crimes environnementaux à coups de pots-de-vin et de violences physiques. Grâce à sa patience et à une empathie sincère, Eugene gagne peu à peu la confiance des victimes — notamment la famille de Mitsuo Yamazaki (Hiroyuki Sanada) — afin de documenter leurs souffrances aux yeux du monde entier.
La principale force du film repose sur l'interprétation pleine d'autorité, de fragilité et d'une farouche détermination de Johnny Depp. Arborant des cheveux grisonnants, une barbe épaisse et d'imposantes lunettes, Depp disparaît complètement derrière le personnage d'Eugene Smith, cynique en apparence mais doté d'une sensibilité extraordinaire derrière l'objectif de son appareil photo. La transition émotionnelle d'Eugene, passant d'un homme en colère coupé de la société à une figure prête à risquer sa vie pour porter la voix des sans-voix, est exécutée avec une grande justesse sans jamais tomber dans le mélodrame.
Au-delà de la performance de Depp, la distribution secondaire japonaise insuffle à l'ensemble du récit un souffle d'humanité authentique. Hiroyuki Sanada brille dans le rôle de Mitsuo Yamazaki, un meneur de la contestation locale partagé entre le désespoir et une résolution inébranlable pour l'avenir de leurs enfants. Parallèlement, Minami, dans le rôle d'Aileen Mioko Smith, constitue un contrepoids émotionnel essentiel, illustrant un partenariat grandissant et une romance née sous la menace constante d'un danger mortel.
Sur le plan de l'esthétique et de la photographie, Minamata propose une approche visuelle poétique fermement ancrée dans un réalisme documentaire âpre. Le directeur de la photographie Benoît Delhomme utilise une palette de couleurs grisâtres atténuées et l'éclairage tamisé de la chambre noire pour refléter à la fois l'état intérieur d'Eugene et l'atmosphère morose d'une ville empoisonnée. La scène dans laquelle Eugene développe l'emblématique photographie Tomoko et sa mère dans le bain en chambre noire s'impose comme l'un des moments cinématographiques les plus forts et les plus déchirants, donnant vie à l'histoire du photojournalisme directement sous les yeux du spectateur.
La partition musicale, composée par le regretté et légendaire Ryuichi Sakamoto, enrichit remarquablement la dimension émotionnelle du film. De douces notes de piano minimalistes se mêlent à des mélodies orchestrales mélancoliques pour accompagner chaque scène de tragédie et de résistance citoyenne sans jamais paraître excessivement manipulatrices. La musique de Sakamoto offre un espace silencieux et sacré permettant aux visages des victimes de s'exprimer d'eux-mêmes à travers les portraits en noir et blanc d'Eugene Smith.
Cependant, sur le plan de la structure narrative, certains critiques ont relevé que l'intrigue suit encore une formule dramatique assez conventionnelle du « sauveur occidental », où les luttes de longue haleine des militants locaux sont parfois éclipsées par les conflits personnels du protagoniste. Plusieurs antagonistes de la Chisso Corporation sont également dépeints de manière quelque peu unidimensionnelle comme des figures malveillantes manquant de nuances. Dans l'ensemble, malgré son approche narrative classique, Minamata demeure une œuvre cinématographique essentielle, qui éveille les consciences et met en lumière l'une des meilleures performances d'acteur de Johnny Depp au cours de la dernière décennie.